صمم مركز التطوير الأكاديمي والقيمي عدة برامج لتطبيق منظومة القيم على شرائح متعددة من المجتمع ، وقد تم تطبيق بعضها مع مؤسسات أكاديمية وتربوية، شريكة في المنظومة، ومن أهم هذه البرامج:
1-برنامج فرسان القيم بنسختيه الجامعية والمدرسية.
2-برنامج أئمة الهدى والمخصص لوزارة الأوقاف.
3-برنامج فتية الإيمان والمخصص للمراكز القرآنية والأندية الإسلامية.