تهدف منظومة القيم التطبيقية إلى تحقيق مجموعة متكاملة من الغايات، يمكن بيانها على النحو الآتي:
تكوين الشخصية الإسلامية الخلوقة والفاعلة.
إكساب الأفراد مهارات القيادة والإدارة الرشيدة ليصبحوا قادة المستقبل.
إعداد كفاءات علمية ومعرفية تجمع بين التخصص الاكاديمي الرصين والمواكبة لمتطلبات النهضة المعاصرة. مع الحفاظ على الأصالة الأخلاقية والقيمية لهذه الأمة المباركة.
تعزيز الجانب القيمية والأخلاقية والمهارية عند الفئات المستهدفة.
تحقيق الحياة الفضلى للمجتمع.
التفاعل مع تحديات العصر والقدرة على التأثير فيها.
تفعيل دور المؤسسات التعليمية والتربوية في التربية القيمية.
تبصير القائمين بالعملية التعليمية بدورهم في الجانب الأكاديمي والقيمي.
تحقيق مخرجات تعليمية أفضل من خلال توفير البيئة الأخلاقية السليمة في المؤسسات التعليمية والتربوية.
مستلهمين رسالة منظومة القيم التطبيقية: المعرفة والقيم سر صناعة الأجيال.